宮崎内科@大分です。 あまり自信はありませんが、似たビデオボードを使っていますので 気付いた点を書きます。
それならばと、dpkg-reconfigure xserver-xfree86 で RIVA TNT2 を設定すると、 startx で日医標準レセプトソフトが起動して、トラブルなく動きました。 OK ということでshutdown して、また起動するとXが起動せず、動かすためには、 dpkg-reconfigure xserver-xfree86 でまた同様の設定をし直さなくてはなりませ ん。
dpkg-reconfigure xserver-xfree86での再設定で
1)xserver driver  は何を選択されましたか?
     nv  ではいかがでしょうか?
2)途中でframebufferを使うか聞かれると
    思いますが、no を選択されていますか?
    Use kernel framebuffer device interface?
                                    <No>